Rafa Márquez coincidió en el FC Barcelona con Lionel Messi durante la etapa de Pep Guardiola. En ese tiempo el astro argentino apenas se estaba dando a conocer, mientras que el canterano del Atlas ya estaba consolidado. El conflicto que sostuvieron fue durante una pretemporada en Escocia, posiblemente, producto de la inmadurez de la 'Pulga', la cual desespero al histórico '4' del balompié azteca.
"Fue el primer año que llegó Pep Guardiola al equipo. Estábamos haciendo una pretemporada en Escocia. Un partido de cinco contra cinco, siempre te calientas porque siempre quieres jugar. Él era de mi equipo, íbamos perdiendo y él ya sabes, se quitaba uno, se quitaba otro, pero no anotaba, hasta que me enojé y le dije: 'Messi, suelta la pelota', empezamos a discutir y tuvo que intervenir Pep para callar a Messi", reveló en entrevista con el Escorpión Dorado.
